Krater Patomski pozostaje obiektem, którego pochodzenie nie jest znane z całkowitą pewnością. Wszystkie wyjaśnienia mają charakter hipotez, opartych na obserwacjach geologicznych, a nie na jednoznacznym dowodzie. Najczęściej przywoływana teoria mówi, że krater mógł powstać w wyniku rzadkiego, naturalnego procesu geologicznego związanego z gwałtownym wyrzutem skał i gazów w warunkach wiecznej zmarzliny, jednak nie jest to fakt ostatecznie potwierdzony. Zgodnie z tą hipotezą pod obszarem krateru znajdują się struktury tektoniczne, którymi z głębi Ziemi mogły przemieszczać się gazy, głównie metan i dwutlenek węgla. Zakłada się, że gruba warstwa wiecznej zmarzliny mogła zadziałać jak szczelna bariera, zatrzymując gazy i powodując stopniowy wzrost ciśnienia. W pewnym momencie, według tej teorii, doszło do gwałtownego rozładowania, czyli wyrzutu materiału skalnego od wewnątrz, a nie do uderzenia z zewnątrz. Nie ma jednak dowodów na to, że był to proces wulkaniczny, ponieważ w okolicy nie s...